MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen chromosome

Total Repeats: 61287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008346	AAGA	2	8	16	23	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008346	ATT	2	6	99	104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565577
3	NC_008346	TCC	2	6	191	196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114565577
4	NC_008346	TGT	2	6	397	402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114565577
5	NC_008346	TGC	2	6	427	432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565577
6	NC_008346	AT	3	6	482	487	50 %	50 %	0 %	0 %	114565577
7	NC_008346	G	7	7	488	494	0 %	0 %	100 %	0 %	114565577
8	NC_008346	CAT	2	6	533	538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565577
9	NC_008346	TTCT	2	8	540	547	0 %	75 %	0 %	25 %	114565577
10	NC_008346	TATG	2	8	568	575	25 %	50 %	25 %	0 %	114565577
11	NC_008346	TCC	2	6	578	583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114565577
12	NC_008346	GAC	2	6	620	625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565577
13	NC_008346	AATA	2	8	644	651	75 %	25 %	0 %	0 %	114565577
14	NC_008346	TTC	2	6	666	671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114565577
15	NC_008346	GAA	2	6	716	721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565577
16	NC_008346	TTC	2	6	722	727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114565577
17	NC_008346	AGT	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565577
18	NC_008346	CGAC	2	8	778	785	25 %	0 %	25 %	50 %	114565577
19	NC_008346	CCT	2	6	860	865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114565577
20	NC_008346	A	6	6	896	901	100 %	0 %	0 %	0 %	114565577
21	NC_008346	TTCTG	2	10	931	940	0 %	60 %	20 %	20 %	114565577
22	NC_008346	GGAG	2	8	982	989	25 %	0 %	75 %	0 %	114565577
23	NC_008346	TTA	2	6	993	998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565577
24	NC_008346	CTA	2	6	1014	1019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565577
25	NC_008346	TAA	2	6	1021	1026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565577
26	NC_008346	A	6	6	1116	1121	100 %	0 %	0 %	0 %	114565577
27	NC_008346	ATT	2	6	1157	1162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565577
28	NC_008346	A	8	8	1165	1172	100 %	0 %	0 %	0 %	114565577
29	NC_008346	AAC	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565577
30	NC_008346	CTT	2	6	1236	1241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114565577
31	NC_008346	ATGC	2	8	1289	1296	25 %	25 %	25 %	25 %	114565577
32	NC_008346	A	7	7	1364	1370	100 %	0 %	0 %	0 %	114565577
33	NC_008346	ATT	2	6	1385	1390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565577
34	NC_008346	CAA	2	6	1404	1409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008346	CTA	3	9	1475	1483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565578
36	NC_008346	TAC	2	6	1485	1490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565578
37	NC_008346	TAA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565578
38	NC_008346	A	8	8	1503	1510	100 %	0 %	0 %	0 %	114565578
39	NC_008346	A	8	8	1553	1560	100 %	0 %	0 %	0 %	114565578
40	NC_008346	AGC	2	6	1593	1598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565578
41	NC_008346	T	7	7	1761	1767	0 %	100 %	0 %	0 %	114565578
42	NC_008346	TTA	2	6	1780	1785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565578
43	NC_008346	A	7	7	1906	1912	100 %	0 %	0 %	0 %	114565578
44	NC_008346	AAG	2	6	1949	1954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565578
45	NC_008346	AAG	2	6	1960	1965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565578
46	NC_008346	GTA	2	6	2050	2055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565578
47	NC_008346	ATT	2	6	2128	2133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565578
48	NC_008346	GAT	2	6	2170	2175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565578
49	NC_008346	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565578
50	NC_008346	CAA	2	6	2229	2234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565578
51	NC_008346	CTT	2	6	2235	2240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114565578
52	NC_008346	GAT	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565578
53	NC_008346	GAA	2	6	2413	2418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565578
54	NC_008346	GAGGTA	2	12	2422	2433	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	114565578
55	NC_008346	AAT	2	6	2448	2453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565578
56	NC_008346	GGTGAA	2	12	2497	2508	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	114565578
57	NC_008346	ATT	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565578
58	NC_008346	GAAA	2	8	2683	2690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008346	GATA	2	8	2691	2698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008346	A	6	6	2740	2745	100 %	0 %	0 %	0 %	114565579
61	NC_008346	AT	3	6	2775	2780	50 %	50 %	0 %	0 %	114565579
62	NC_008346	TAC	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565579
63	NC_008346	GCA	2	6	2856	2861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565579
64	NC_008346	A	6	6	2868	2873	100 %	0 %	0 %	0 %	114565579
65	NC_008346	GA	3	6	2930	2935	50 %	0 %	50 %	0 %	114565579
66	NC_008346	ACCG	2	8	3014	3021	25 %	0 %	25 %	50 %	114565579
67	NC_008346	AAT	2	6	3028	3033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565579
68	NC_008346	GAT	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565579
69	NC_008346	T	8	8	3089	3096	0 %	100 %	0 %	0 %	114565579
70	NC_008346	ATTT	2	8	3129	3136	25 %	75 %	0 %	0 %	114565579
71	NC_008346	A	7	7	3164	3170	100 %	0 %	0 %	0 %	114565579
72	NC_008346	TAT	2	6	3177	3182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565579
73	NC_008346	A	7	7	3184	3190	100 %	0 %	0 %	0 %	114565579
74	NC_008346	GAA	2	6	3191	3196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565579
75	NC_008346	TAAT	2	8	3219	3226	50 %	50 %	0 %	0 %	114565579
76	NC_008346	AGC	2	6	3244	3249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565579
77	NC_008346	ACT	2	6	3253	3258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565579
78	NC_008346	ATG	2	6	3327	3332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565579
79	NC_008346	CTTT	2	8	3359	3366	0 %	75 %	0 %	25 %	114565579
80	NC_008346	AAG	2	6	3416	3421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565579
81	NC_008346	GAAAAG	2	12	3440	3451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565579
82	NC_008346	CTG	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565579
83	NC_008346	TTTG	2	8	3561	3568	0 %	75 %	25 %	0 %	114565579
84	NC_008346	AAT	2	6	3580	3585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565579
85	NC_008346	GAC	2	6	3650	3655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565579
86	NC_008346	AGT	2	6	3792	3797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565579
87	NC_008346	AAC	2	6	3821	3826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565580
88	NC_008346	ATT	2	6	3830	3835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565580
89	NC_008346	CCT	2	6	3872	3877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114565580
90	NC_008346	TGA	2	6	4272	4277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565581
91	NC_008346	CGG	2	6	4368	4373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565581
92	NC_008346	GTA	2	6	4420	4425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565581
93	NC_008346	AT	3	6	4472	4477	50 %	50 %	0 %	0 %	114565581
94	NC_008346	CAG	2	6	4480	4485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565581
95	NC_008346	ATA	2	6	4522	4527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565581
96	NC_008346	T	7	7	4560	4566	0 %	100 %	0 %	0 %	114565581
97	NC_008346	GAT	2	6	4570	4575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565581
98	NC_008346	GAA	2	6	4585	4590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565581
99	NC_008346	GA	4	8	4675	4682	50 %	0 %	50 %	0 %	114565581
100	NC_008346	AGA	3	9	4680	4688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565581
101	NC_008346	T	6	6	4691	4696	0 %	100 %	0 %	0 %	114565581
102	NC_008346	TAA	2	6	4746	4751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565581
103	NC_008346	TTA	2	6	4763	4768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565581
104	NC_008346	AAGA	2	8	4795	4802	75 %	0 %	25 %	0 %	114565581
105	NC_008346	CAATA	2	10	4828	4837	60 %	20 %	0 %	20 %	114565581
106	NC_008346	AAT	2	6	4870	4875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565581
107	NC_008346	ATA	2	6	4958	4963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565581
108	NC_008346	ATA	2	6	4979	4984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565581
109	NC_008346	CGG	2	6	5153	5158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565581
110	NC_008346	A	6	6	5215	5220	100 %	0 %	0 %	0 %	114565581
111	NC_008346	CGG	2	6	5236	5241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565581
112	NC_008346	CCCT	2	8	5264	5271	0 %	25 %	0 %	75 %	114565581
113	NC_008346	GCA	2	6	5288	5293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565581
114	NC_008346	GTT	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114565581
115	NC_008346	GGAG	2	8	5328	5335	25 %	0 %	75 %	0 %	114565581
116	NC_008346	GGA	2	6	5344	5349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565581
117	NC_008346	AAGG	2	8	5360	5367	50 %	0 %	50 %	0 %	114565581
118	NC_008346	GC	3	6	5425	5430	0 %	0 %	50 %	50 %	114565581
119	NC_008346	GAA	2	6	5452	5457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565581
120	NC_008346	TTA	2	6	5468	5473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565581
121	NC_008346	TAT	2	6	5538	5543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565581
122	NC_008346	TTAC	2	8	5584	5591	25 %	50 %	0 %	25 %	114565581
123	NC_008346	CTT	2	6	5592	5597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114565581
124	NC_008346	AT	3	6	5604	5609	50 %	50 %	0 %	0 %	114565581
125	NC_008346	AGA	2	6	5622	5627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565581
126	NC_008346	TA	3	6	5638	5643	50 %	50 %	0 %	0 %	114565581
127	NC_008346	C	7	7	5650	5656	0 %	0 %	0 %	100 %	114565581
128	NC_008346	ATG	2	6	5699	5704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565581
129	NC_008346	ACT	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565581
130	NC_008346	AGA	2	6	5844	5849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565581
131	NC_008346	AGG	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565581
132	NC_008346	TGCCC	2	10	6074	6083	0 %	20 %	20 %	60 %	114565582
133	NC_008346	A	6	6	6168	6173	100 %	0 %	0 %	0 %	114565582
134	NC_008346	TGCCGC	2	12	6323	6334	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114565582
135	NC_008346	GCG	2	6	6369	6374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565582
136	NC_008346	GGC	2	6	6412	6417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565582
137	NC_008346	ATG	2	6	6424	6429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565582
138	NC_008346	GAA	2	6	6438	6443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565582
139	NC_008346	CCA	2	6	6514	6519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114565582
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150	NC_008346	AAC	2	6	7067	7072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565582
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253	NC_008346	TAT	2	6	12021	12026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565585
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262	NC_008346	TAA	2	6	12635	12640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_008346	GAAT	2	8	12746	12753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
264	NC_008346	AGG	2	6	12762	12767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
265	NC_008346	TAT	2	6	12772	12777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565586
266	NC_008346	GGA	2	6	12885	12890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565586
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268	NC_008346	A	6	6	12959	12964	100 %	0 %	0 %	0 %	114565586
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399	NC_008346	GCCG	2	8	19917	19924	0 %	0 %	50 %	50 %	114565590
400	NC_008346	ACC	2	6	19976	19981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114565590
401	NC_008346	GCT	2	6	19990	19995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565590
402	NC_008346	GGTAT	2	10	20096	20105	20 %	40 %	40 %	0 %	114565590
403	NC_008346	GAG	2	6	20150	20155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565590
404	NC_008346	GCC	2	6	20156	20161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565590
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431	NC_008346	GT	3	6	21152	21157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
432	NC_008346	ATT	2	6	21187	21192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_008346	ATATA	2	10	21193	21202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_008346	TAT	2	6	21213	21218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_008346	GAA	2	6	21229	21234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
436	NC_008346	AAG	2	6	21318	21323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_008346	GAA	2	6	21389	21394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_008346	GCA	2	6	22325	22330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_008346	AGC	2	6	22331	22336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_008346	AATC	2	8	22380	22387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
456	NC_008346	ATC	2	6	22437	22442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
457	NC_008346	GA	3	6	22498	22503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
458	NC_008346	ATT	2	6	22511	22516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_008346	GAA	2	6	22602	22607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
460	NC_008346	GCA	2	6	22654	22659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_008346	TAA	2	6	22669	22674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_008346	TCCC	2	8	22770	22777	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
463	NC_008346	GAA	2	6	22907	22912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565593
464	NC_008346	ATA	2	6	22920	22925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565593
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472	NC_008346	T	6	6	23245	23250	0 %	100 %	0 %	0 %	114565593
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475	NC_008346	T	6	6	23324	23329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_008346	CAT	2	6	23442	23447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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483	NC_008346	TTG	2	6	23495	23500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
484	NC_008346	ATATC	2	10	23515	23524	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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486	NC_008346	GAA	2	6	23647	23652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
487	NC_008346	TGGGA	2	10	23653	23662	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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